De peste 30 de ani, BIOVIA este un pionier în dezvoltarea reprezentării și manipulării datelor chimice. Compania a inventat și continuă să actualizeze formatele de fișiere standard din industrie: mol, rxn, SDFile, RDFile și XDfile care, datorită unor instrumente precum BIOVIA Draw, BIOVIA Direct și BIOVIA Pipeline Pilot, contribuie semnificativ la arsenalul comunității științifice de medii informatice. BIOVIA Chemistry, echipată cu funcții pentru schițarea, stocarea și recuperarea moleculelor complexe, ocupă un loc central în furnizarea de suport complet pentru diverse nevoi de cercetare.
Reprezentarea chimică
BIOVIA oferă două programe pentru schițarea moleculelor, reacțiilor și secvențelor – BIOVIA Draw și Pipette Sketcher. BIOVIA Draw, o aplicație desktop .NET personalizabilă, e utilizată zilnic de zeci de mii de oameni de știință. Ea le permite cercetătorilor să schițeze cu precizie și corectitudine chimică entitățile lor științifice pentru înregistrare sau interogări.
În ultimele două decenii, BIOVIA a oferit programe de schițare bazate pe web. JDraw a fost extrem de popular. Ulterior, a fost înlocuit cu Pipette Sketcher, un program de schițare JavaScript modern, conectat la Pipeline Pilot Chemistry, care oferă o inteligență chimică similară celei de la BIOVIA Draw.
Pipette Sketcher are o interfață unică, centrată pe date chimice, dovedindu-se a fi mai rapidă și mai puțin predispusă la erori decât opțiunile tradiționale de schițare. În plus, a fost extinsă pentru a suporta peptide și ARN, cu comutare perfectă între formatele SCSR și HELM. De asemenea, Pipette Sketcher poate fi configurat pentru a suporta diferite fluxuri de lucru de schițare, în funcție de nevoile aplicațiilor web care îl încorporează. Fluxuri de lucru respective includ:
- Schițarea a orice: reacții, molecule mici și secvențe [pentru secvențe, Pipette Sketcher folosește un editor HELM ușor de utilizat] (Fig. 1).
- Schițarea exclusivă a moleculelor mici și reacțiilor.
- Schițarea exclusivă a moleculelor mici, cu creionarea reacției dezactivată [ideal pentru înregistrarea moleculelor] (Fig. 2).
Figura 1. Schițați orice: molecule, reacții și secvențe.
Figura 2. Schițați doar moleculele mici
Flexibilitate sporită în Pipette Sketcher
Pipette Sketcher a fost actualizat. S-a introdus o nouă funcție, care le permite utilizatorilor, familiarizați cu alte programe de schițare, să deseneze molecule și reacții în modul lor preferat. Utilizatorii vor putea decide dacă doresc să schițeze în Pipette, folosind modul chimic sensibil la context, (așa cum au făcut-o în ultimul deceniu), sau să schimbe interfața la o experiență de schițare consacrată, centrată pe instrumente, precum BIOVIA Draw și alte programe populare de schițare chimică.
Noua opțiune de schițare oferă instrumente familiare pentru acțiuni comune, legături și atomi, șabloane și o zonă de feedback.
Actualizarea Pipette Scketcher
Instrumente de desen și editare
Programul Pipette Sketcher oferă o interfață de desen intuitivă, cu diverse instrumente, pentru crearea și modificarea structurilor chimice, printre care se numără instrumentele de desen, șabloanele și comenzile rapide.
Pipette Sketcher oferă aceleași capacități de schițare și creare de substanțe chimice ca BIOVIA Draw, inclusiv:
- Stereochimie relativă și îmbunătățită:
- Tetraedrică
- Axială
- Stereochimie de ordin superior
- Geometrică
- Unități repetitive (grupuri S și grupuri S de date)
- Grupuri R
- Legături haptice și Markush
- Abrevieri
- Caracteristici ale interogării (atom și legătură)
- Reacții (aspect automat)
Compatibilitate multiplatformă:
- Deoarece Pipette Sketcher este complet bazat pe web, nu sunt necesare plug-in-uri sau add-in-uri de browser, fiind disponibil pe diferite sisteme de operare și dispozitive.
Pipette Sketcher este ușor de utilizat pe dispozitive tactile, inclusiv:
- iOS și Android
- Tablete Windows și laptopuri cu ecran tactil
Integrare cu alte instrumente:
- BIOVIA Pipette Sketcher este compatibil cu aplicații de pe platforma 3DEXPERIENCE și poate fi utilizat cu alte aplicații BIOVIA. De asemenea, se integrează cu ușurință în aplicații web sau desktop personalizate, precum și în aplicațiile altor organizații externe (prin intermediul API-ului său testat și verificat).
Manipularea structurii:
- Pipette acceptă diverse manipulări structurale, cum ar fi conversia între diferite formate (HELM, RINChI , SMILES, mol, skc, rxn, cdx, sdf, rdf, xdf) și curățarea structurilor.
Partajare și colaborare:
- Permite partajarea ușoară a structurilor chimice prin diverse formate de fișiere, inclusiv crearea de imagini, facilitând colaborarea și partajarea cunoștințelor.
Concluzie
BIOVIA Pipette Sketcher oferă atât experiența familiară de schițare a BIOVIA Draw și a altor instrumente populare de schițare chimică, precum și o experiență modernă, centrată pe date chimice, rafinată prin studii de fezabilitate. Indiferent de experiența selectată, utilizatorul se bucură de flexibilitatea și accesibilitatea unei aplicații web, perfect integrată cu celelalte instrumente.
Pipette Sketcher se bazează pe instrumentele existente ale BIOVIA, oferind o soluție suplimentară, convenabilă și eficientă, pentru schițarea, partajarea și colaborarea la structuri și reacții chimice.
Dacă vă sunt utile articolele noastre, nu ezitați să vă abonați la newsletter.